Семинар ММИТ//Доклад Михаила Богатырева "Применение многомерных формальных контекстов в анализе биомедицинских текстов"

Тема доклада: "Применение многомерных формальных контекстов в анализе биомедицинских текстов"
Аннотация: Автоматизированный анализ биомедицинских текстов является активно развивающимся направлением биоинформатики, известным как BioNLP – Biomedical Natural Language Processing. Классическими задачами BioNLP являются задачи извлечения из текстов именованных сущностей и отношений между ними. В последнее время появилась тенденция  применять в решениях задач BioNLP модели и методы Data & Text Mining, а также методы машинного обучения.
В докладе рассматривается применение многомерных формальных контекстов  для установления семантических связей между биомедицинскими текстами. Формальные контексты – основной объект Анализа формальных понятий – строятся с применением схем Абстрактного представления смысла (Abstract Meaning Representation –AMR) и кон-цептуальных графов. Показано, что концептуальные графы, построенные на текстах с применением разметки семантических ролей, позволяют моделировать основные AMR-схемы.
Доклад содержит результаты экспериментов по построению трёх- и четырёхмерных формальных контекстов на известных данных, формируемых для стандартных задач BioNLP  Shared Tasks. Данные представляют собой тексты аннотаций статей из системы PubMed, слабо связанных друг с другом, но в целом посвящённых исследованию мутаций генов. На формальных контекстах решается задача кластеризации и анализируются полученные кластеры как источники фактов и связей между текстами. 
Обсуждается применимость к многомерным формальным контекстам гипотезы «семантической выразительности» многомерных концептуальных моделей: чем выше размерность такой модели, тем глубже она позволяет моделировать смысл текста.
Место проведения: Покровский бульвар, 11, ауд. R 207