• A
  • A
  • A
  • АБB
  • АБB
  • АБB
  • А
  • А
  • А
  • А
  • А
Обычная версия сайта

Cеминар по биоинформатике "Трехмерная структура хроматина: вчера и завтра." Докладчик: Михаил Гельфанд, ФКН ВШЭ

Мероприятие завершено


На факультете компьютерных наук состоится очередной семинар*, посвященный методам машинного обучения в биоинформатике. Руководит семинаром Мария Попцова, доцент департамента больших данных и информационного поиска. 

Методы машинного обучения уже нашли широкое применение в областях генетики и геномики. Они оказались наиболее полезны для интерпретации больших наборов геномных данных и аннотации большого числа элементов генома. Методы машинного обучения были успешно применены для распознавания сайтов старта транскрипции, сплайс-сайтов, альтернативного сплайсинга, промотеров, энхансеров, расположения нуклеосом. После революции в технологиях секвенирования накопление экспериментальных данных происходит быстрее, чем построение моделей, объясняющих функционирование генома. Необходима как разработка новых подходов, методов и алгоритмов, так и освоение технологий работы с системами больших данных геномики. На научном семинаре мы будем знакомиться с современными исследованиями в области применения методов машинного обучения к анализу геномных данных ведущих университетов мира, таких как Harvard, MIT, Cambridge, Sorbonne, EMBL-EBI и др.

Следующий семинар состоится 11 декабря в 18:10, аудитория 205, по адресу Кочновский пр-д, д.3.


Трехмерная структура хроматина: вчера и завтра

профессор М.С. Гельфанд, руководитель магистерской программы «Анализ данных в биологии и медицине»

Как обычно в молекулярной биологии, прогресс в понимании следует за прогрессом в развитии экспериментальных методик. Одной из таких методик является HiC — способ определять контакты между фрагментами генома в масштабах целого ядра, и таким образом описывать трехмерную структуру хроматина. А дальше ее можно сопоставлять с данными об экспрессии генов и об эпигенетических метках, таких как модификации гистонов, то есть, о функциональном состоянии тех или иных участков генома. Я расскажу о некоторых недавних результатх в этой области — но она настолько быстро развивается, что, похоже, часть из того, что будет рассказано, уже устарела (я скажу, какая, и в чем может заключаться дальнейшее развитие).

*Информация о прошедших семинарах по биоинформатике доступна по ссылке.