Научный семинар НУЛ БИО: Анна Курилович "Анализ связи между вторичной организацией ДНК, эпигенетическими маркёрами и структурными мутациями в онкологии"

Изменения в экспрессии онкогенов и генов онкосупрессоров, ведущие к развитию и прогрессированию онкологических патологий, происходят в результате в том числе мутационных событий. Доклад посвящен анализу пространственной корреляции между структурными соматическими мутациями пациентов с онкологическими патологиями девяти тканей и пространственной организацией генома. Были опробованы два подхода к сформулированной задаче. Первый поход включает в себя поиск регионов, в которых имеют место разрывы цепи ДНК у ряда пациентов с онкологическими заболеваниями различных тканей (скоплений мутаций). Охарактеризовано пространственное окружение такого рода участков. Второй подход заключается в поиске пространственных корреляций между структурными мутациями всех пациентов с общим диагнозом и пространственными факторами -  вторичными структурами ДНК и эпигенетическими маркёрами, методами машинного обучения.