Семинары 2026
15.01.2026 [online] Анализ распределения seed-регионов сайтов связывания микроРНК в различных функциональных областях генома человека
Zoom
Докладчик: Башкатов Артем, младший научный сотрудник
В докладе представлены результаты полногеномного анализа локализации сайтов связывания микроРНК (миРНК) в различных функциональных и регуляторных элементах генома, включая промоторы, энхансеры, экзоны, 5'- и 3'-нетранслируемые области (UTR), а также ретротранспозоны (LTR, SINE, LINE).
21.01.2026 [online] Неканонические структуры ДНК, взаимодействующие с каноническими мотивами для функционирования локусов HOT
Zoom
Докладчик: Виана де Баррос Зенобио Антонио, научный сотрудник
Мы составили карту и охарактеризовали не-B структуры ДНК (флипоны), включая Z-ДНК, G-квадруплексы и триплексы, в локусах с высокой степенью занятости (HOT), которые представляют собой участки генома, связанные с необычно большим количеством факторов транскрипции. Интегрируя структурные прогнозы с мультиомическими данными и применяя строгое статистическое моделирование, мы обнаружили, что различные типы флипонов играют разные роли в регуляции транскрипции и доступности хроматина. Наши результаты показывают, что флипоны являются неотъемлемой частью регуляторного механизма в этих активных участках генома, работая вместе с мотивами последовательности и влияя на транскрипцию.
28.01.2026 [online] Характеристика LG4
Zoom
Докладчик: Коновалов Дмитрий, младший научный сотрудник
Известно, что в геноме человека большая доля последовательностей представлена повторами. В данном докладе приведены рзультаты характеристики длинных участков, подобных g квадруплексам (LG4) - участков с высоким содержанием мотива GGG разделенных длинными петлями. Исследована их потенциальная роль в регуляции экспрессии генов.
04.02.2026 [online] Анализ колокализации сайтов связывания микроРНК и G-квадруплексов в промоторных областях генов человека
Zoom
Докладчик: Башкатов Артем, младший научный сотрудник
В докладе представлены результаты исследования колокализации консервативных микроРНК (миРНК) человека и G-квадруплексов в промоторных регионах. Для анализа промоторных треков применялись данные коровых и тканеспецифичных предсказаний, сгенерированные с использованием моделей глубокого обучения DeepGQ.
11.02.2026 [online] Флипоны и эпигенетический ландшафт: геномный анализ структуры ДНК и контекста хроматина
Zoom
Докладчик: Виана де Баррос Зенобио Антонио, научный сотрудник
Мы применяем аналогичную систему сопоставления для изучения связи флипонов с более широким эпигенетическим ландшафтом. Цель состоит в том, чтобы систематически анализировать совместное возникновение и потенциальное взаимодействие между флипонами и эпигенетическими маркерами, такими как модификации гистонов (например, H3K4me1, H3K27ac), состояния доступности хроматина и паттерны метилирования ДНК. Это поможет выяснить, действуют ли флипоны как структурные каркасы, которые привлекают или стабилизируют эпигенетические сигналы, и как эти взаимодействия могут способствовать регуляции генов в различных геномных контекстах.
25.02.2026 [online] Роль "целующихся" петель гуаниновых квадруплексов в регуляции экспрессии генов.
Zoom
Докладчик: Коновалов Дмитрий, младший научный сотрудник
Взаимодействия петель квадруплексов могут стабилизировать энхансер-промоторные петли. Помимо стекинг-взаимодействия тетрад возможно взаимодействие петель квадруплексов посредством гибридизации, аналогично взаимодействию петель "целующихся шпилек". В данном докладе представлены результаты исследования таких взаимодействий и изучена их потенциальная роль в регуляции экспрессии генов.
04.03.2026 [online] Объединение анализа микробиома и протеома
Zoom
Докладчик: Козлова Александра, стажер-исследователь
В докладе был рассмотрен опыт комбинации метагеномных и протеомных исследований. Метагеномика показывает, какие гены и микроорганизмы присутствуют, а протеомика – какие из них реально активны и функционируют. Вместе они позволяют связать состав сообщества с его реальной биологической активностью. Это даёт более полное понимание процессов в экосистемах, медицине и биотехнологиях. В докладе был описан рабочий конвейер первичной обработки данных, проведения анализа метагеномов и объединения полученных данных с протеомным секвенированием. Также были приведены доступные программные обеспечения, позволяющие проводить соответствующий анализ.
11.03.2026 [online] Роль опухоль-ассоциированных фибробластов (CAFs) в патогенезе глиобластомы
Zoom
Докладчик: Исмаилов Алы Мехти Оглы, стажер-исследователь
CAFs играют ключевую роль в патогенезе глиобластомы, формируя микроокружение опухоли через ремоделирование внеклеточного матрикса, подавление иммунного ответа (рекрутирование TAMs, PD-L1, TIGIT, IL-6, TGF-β) и стимуляцию ангиогенеза (VEGF, CXCL12), что поддерживает инвазивность и гипоксию; приоритетом является анализ лиганд-рецепторных взаимодействий (IGFBP6, IL-6) как потенциальных терапевтических мишеней.
08.04.2026 [online] Методологические подходы к классификации клеток ГБМ на основе хромосомных профилей экспрессии
Zoom
Докладчик: Исмаилов Алы Мехти Оглы, стажер-исследователь
Классификация клеток глиобластомы основана на хромосомных профилях экспрессии (CNV, напр. +7/−10) с использованием ML; данные scRNA-seq преобразуются в геномные сигналы с применением сглаживания и HMM, а модели включают L1-логистическую регрессию, ансамбли (Random Forest, XGBoost) и 1D-CNN; далее планируется интеграция с пространственными данными CAFs для анализа связи генетики опухоли и стромы.
22.04.2026 [online] Анализ метагенома медоносных пчел
Zoom
Докладчик: Козлова Александра, стажер-исследователь
На докладе была представлена презентация, посвящённая исследованию микробиома пчёл. В ней рассматривался состав микроорганизмов, обитающих в организме пчёл, и их роль в поддержании здоровья. Особое внимание уделялось влиянию факторов окружающей среды на микробное сообщество. Были приведены примеры того, как условия среды могут изменять состав и активность микроорганизмов. Также обсуждалось значение этих изменений для устойчивости пчёл и экосистем в целом.
Нашли опечатку?
Выделите её, нажмите Ctrl+Enter и отправьте нам уведомление. Спасибо за участие!
Сервис предназначен только для отправки сообщений об орфографических и пунктуационных ошибках.