Семинар по биоинформатике
На семинаре планируется обсудить возможные постановки задач по биоинформатике. Предполагается, что по итогам семинара возникнут новые коллаборации между специалистами в области анализа данных и биологами.
Программа мероприятия
День1
6 мая
10.00 – 11.00
Завтрак
11.00 – 12.20
Методы секвенирования нового поколения
Дмитрий Первушин
12.20 – 12.40
Кофе-брейк
12.40 – 14.00
Вычислительное прогнозирование цис-регуляторных элементов в геномах эукариотов
Дмитрий Светличный
14.00 – 15.00
Обед
15.00 – 16.00
Протеомика
Филипп Хайтович
16.00 – 16.20
Кофе-брейк
16.20 – 17.30
Масс-спектрометрия метаболитов и липидов
Илья Курочкин
17.30 – 19.00
Машинное обучение в иммунологии
Вадим Назаров
19.00 – 20.00
Ужин
День2
7 мая
10.00 – 11.00
Завтрак
11.00 – 12.50
Обнаружение аномалий
Евгений Бурнаев
12.50 – 13.10
Кофе-брейк
13.10 – 14.00
Модели на основе гауссовских процессов для регрессии и классификации, часть 1
Евгений Бурнаев
14.00 – 15.00
Обед
15.00 – 16.00
Модели на основе гауссовских процессов для регрессии и классификации, часть 2
Евгений Бурнаев
16.00 – 16.20
Кофе-брейк
16.20 – 18.00
Байесовские методы и особенности их применения в задачах анализа данных
Дмитрий Ветров
18.00 – 19.00
Моделирование многообразий
Евгений Бурнаев
19.00 – 20.00
Ужин
20.00 – 21.00
Почему байесовские методы обнаружения сигнала в многоканальной задаче лучше, чем методы на основе правдоподобия
Евгений Бурнаев
День3
8 мая
10.00 – 11.00
Завтрак
11.00 – 11.45
Мотивы в ДНК: идентификация и практические приложения в задачах регуляторной геномики
Иван Кулаковский
11.45 – 12.30
Экспериментальный анализ участков ДНК, связываемых факторами траскрипции: постгеномные методы на основе иммунопреципитации хроматина (ChIP-Seq)
Иван Кулаковский
12.30 – 12.50
Кофе-брейк
12.50 – 13.30
Полногеномное предсказание профиля связывания (по следам соревнования ENCODE-DREAM)
Иван Кулаковский
13.30 – 14.00
СколТех
Денис Столяров
14.00 – 15.00
Обед
15.00 – 16.00
Эпигеномика
Андрей Миронов
16.00 – 16.20
Кофе-брейк
16.20 – 17.20
Трехмерная структура хроматина — экспериментальные методы
Сергей Ульянов
17.20 – 18.00
Пространственная структура хроматина: анализ данных
Екатерина Храмеева
18.00 – 18.30
Пространственная структура и динамика хроматина в гауссовом приближении
Кирилл Половников
18.30 – 19.00
Чем отличается настоящая карта контактов ДНК от случайной матрицы
Валерия Ковалёва
19.00 – 20.00
Ужин
День4
9 мая
10.00 – 11.00
Завтрак
11.00 – 12.30
Введение в машинное обучение, часть 1
Григорий Сапунов
12.30 – 12.50
Кофе-брейк
12.50 – 14.00
Введение в машинное обучение, часть 2
Григорий Сапунов
14.00 – 15.00
Обед
15.00 – 16.30
Введение в глубокое обучение, часть 1
Григорий Сапунов
16.30 – 16.50
Кофе-брейк
16.50 – 18.00
Введение в глубокое обучение, часть 2
Григорий Сапунов