ДНК существует не только в виде канонической двойной спирали, B-формы, но и способна образовывать вторичные структуры:крестообразные структуры, квадруплексы, триплексы, А- и Z-формы. Отдельные эксперименты показывают важную роль этих структур в процессах регуляции генома, но полногеномное аннотирование вторичных структур ДНК (РНК) высокопоточными экспериментами еще не создано. Целью научного исследования группы «ДНК-пунктуация» является разработка программного обеспечения и методов машинного обучения для поиска и функциональной аннотации вторичных структур НК.