Семинары НУГ «Роль вторичных структур ДНК/РНК в функционировании генома»

На семинаре обсуждались типы данных, доступных в результате высокопоточных экспериментов NGS, существующие алгоритмы анализа подобных данных, а  также их программные реализации (ChromaSig and HMMseg).

Семинар 2 "ДНК-структуры: знаки пунктуации для геномных текстов." 07.03.2018

На семинаре обсуждались разнообразные вторичные структуры ДНК: крестообразные структуры, квадруплексы, триплексы, B-, А- и Z-формы.

Семинар 3 "Задача распознавания участка ДНК по физико-химическим и геометрическим свойствам" 23.03.2018

На семинаре ставилась задача для сбора данных, характеризующих любой произвольный участок ДНК физико-химическими и геометрическими свойствами из базы данных динуклеотидных свойств ДНК DiProDB.

Семинар 4 Выступление Отабека Маткаримова "Алгоритм поиска паттернов между плотностями эпигенетических факторов и вторичных структур ДНК" 13.04.2018

На семинаре делал доклад студент 4 курса Отабек Маткаримов. Он представлял разработанный им, в соавторстве с Денисом Поливодой, программный модуль, находящий паттерны корреляции для двух произвольных bed-файлов.

Семинар 5 Доклад Ирины Понамаревой на тему "Сиcтемы CRISPR-Cas 2 класса: обзор механизмов и особенностей разных типов" 18.05.2018

На семинаре с докладом выступала студентка 2 курса Ирина Понамарева. Она осуществила обзор работы CRISPR-Cas белков.

Семинар 6 Доклад Александра Шеина на тему "Аpplication of machine-learning methods to transposing recognition".
Презентация проекта Отабека Маткаримова и Дениса Поливода. 05.06.2018

На семинаре выступил с докладом Александр Шеин на тему "Аpplication of machine-learning methods to transposing recognition". Также с презентацией совместного проекта по поиску паттернов в геномных аннотациях выступили Отабек Маткаримов и Денис Поливода .

Семинар 7 Презентация Павла Мазина на тему "Alternative splicing and around". 22.06.2018

На семинаре выступил Павел Мазин с презентацией на тему "Alternative splicing and around". Павел Рассказал о трех проектах, идущих в лабораотрии профессора Хайтовича Сколтеха.