Семинар 4 Выступление Отабека Маткаримова "Алгоритм поиска паттернов между плотностями эпигенетических факторов и вторичных структур ДНК" 13.04.2018

13 апреля 2018 года на семинаре выступил Отабек Маткаримов с презентацией проекта, выполняемого совместно с Денисом Поливодой. Задачей проекта является разработка алгоритма и программного обеспечения, находящего паттерны корреляции между любыми заданными функциональными элементами, информация о нахождении которых записана в файлах формата bed. В качестве файлов для первоначального тестирования алгоритма и программы были выбраны аннотации генома структурами стебель-петля и аннотации, доступные с сайта консорциумного проекта Roadmap Epigenomics для сайтов чувствительности к ДНКазе (HDNase).  Обсуждались возможные методы улучшения работы алгоритма.