• A
  • A
  • A
  • АБВ
  • АБВ
  • АБВ
  • А
  • А
  • А
  • А
  • А
Обычная версия сайта

Научно-учебная группа "Машинное обучение на данных нейроимаджинга"

Публикации
Публикации участников группы
Глава в книге
Классификация коннектомов на основе локальных метрик на стохастических матрицах

Иванов А. Р., Петров Д. М.

В кн.: Сборник статей конференции "Информационные технологии и системы" (ИТиС'16). М.: ИППИ РАН, 2016. С. 509-516.

Препринт
Kernel classification of connectomes based on earth mover's distance between graph spectra

Dodonova Y., Belyaev M., Tkachev A. et al.

Cornell University Library, 2016

Цель работы группы — разработать и опробовать набор методов машинного обучения для классификации фенотипических групп на основе структурных и функциональных коннектомов. В частности, для различения аутизма и нормы на открытых данных UCLA (94 человека) и для различения людей-носителей аллелей, связанных с высоким риском развития болезни Альцгеймера, и нормы на основе открытых данных UCLA (55 человек).


Neuroscience reading group

Мы начали отдельное направление семинара - Neuroscience reading group, в рамках которого будем регулярно читать и обсуждать статьи из ведущих научных журналов в области нейронаук. В рамках первой встречи была разобрана статья, посвященная уточнению алгоритмов зонирования коры головного мозга на основе интеграции мультимодальных данных.

Deep_pipe: библиотека для глубокого обучения на медицинских снимках

Сотрудники сектора "Анализ данных в нейронауках" ИППИ РАН Егор Кривов и Максим Писов представили разработанную ими библиотеку для реализации архитектур глубокого обучения на биомедицинских данных, в том числе на данных нейровизуализации. 

Использование гауссовских процессов для выявления связи между генотипом и фенотипом в данных Enroll-HD

In this work we consider Functional Dimensionality Reduction for Gaussian Processes applied for investigation of Huntington Disease. We are going to give short theoretical overview of the method, remind what is Gaussian Processes, discuss PCA and Sparse PCA, consider methods of calculation explained variance in case of not orthogonal loads. Also we will look at synthetic samples of using EDR-GP and present our library edr-gp. The major part of this work is dedicated to results of applying this approach to EnrollHD database.

Актуальные исследования в коннектомике

Студент НУГ Анвар Курмуков рассказал о последних работах по коннектомам, в том числе о нескольких работах с конференции MICCAI: как с основного трека, так и с двух профильных воркшопов о сетевых структурах - CNI и GRAIL. Вместе с Аягоз Мусабаевой они также рассказали об исследовательском проекте, который начали совместо с Борисом Гутманом, сотрудником Университета Южной Калифорнии.

Открытые проблемы в сегментации медицинских изображений

Михаил Беляев, заведующий сектором "Анализ данных в нейронауках" ИППИ РАН, расскажет об открытых проблемах в сегментации медицинских изображений. Студенты Физтеха Владимир Кондратенко и Александр Денисенко, выполняющие дипломные работы под руководством Михаила, сделают обзор статей с воркшопа "Large-scale Annotation of Biomedical data end Expert Label Synthesis" конференции MICCAI.

Машинное обучение в нейроимаджинге и генетике

На семинаре выступил Борис Гутман, сотрудник Imaging Genetics Center Университета Южной Калифорнии. Борис рассказал про интересные ему задачи в нейроимаджинге и генетике, в которых могут быть полезны методы машинного обучения.

Готовимся к докладам на ИТиС-2017

На семинаре мы готовились к представлению результатов на ежегодной конференции ИППИ РАН "Информационные технологии и системы": у участников семинара принято пять работ для устных докладов и шесть работ для постерных докладов.

Готовимся к докладам на MICCAI

На семинаре обсуждался доклад Анвара Курмукова «Classifying phenotypes based on the community structure of human brain networks», который будет представлен  на тематическом воркшопе профильной конференции Medical Image Computing and Computer Assisted Interventions (10 –14 сентября 2017, Квебек, Канада)

Рабочий семинар: итоги учебного года и планы на следующий год

Итогом очередного учебного года традиционно стало оформление всех завершенных проектов для представления на ежегодной школе-конференции ИППИ РАН "Информационные технологии и системы": всего подано 11 работ от участников нашего семинара, в том числе от студентов НУГ Аягоз Мусабаевой, Марины Ананьевой, Маргариты Буровой, Анвара Курмукова и Амира Сафиуллина. На очередном семинаре мы обсудили планы на следующий учебный год. 

Готовим работы для 41-й школы-конференции "Информационные технологии и системы"

На прошедшем семинаре краткие доклады делали студенты, готовящие работы для 41-й конференции "Информационные технологии и системы". Свои проекты представили студенты НУГ Аягоз Мусабаева, Марина Ананьева и Маргарита Бурова.