Семинар НУЛ ИИВБ: "Implementing a Label-Free Quantification Method in the crux-toolkit"
Аспирант Департамента анализа данных и искусственного интеллекта Факультета компьютерных наук
Во вторник, 28 ноября в 16:00 в Научно-учебной лаборатории искусственного интеллекта для вычислительной биологии состоится онлайн-семинар на тему "Implementing a Label-Free Quantification Method in the crux-toolkit".
Докладчиком выступит Аквей Фрэнк Лоренс Ний Адокквей, аспирант Департамента анализа данных и искусственного интеллекта Факультета компьютерных наук.
Аннотация:
When doing bottom-up proteomics experiments with mass spectrometry, one seeks not only to identify peptides but also to identify the abundance of said peptides. One way of doing this is through Label-Free Quantification. These methods tend to be cheaper than chemical tagging albeit computationally expensive. However, FlashLFQ implemented a method which speeds up the computation time by orders of magnitude.
The goal of my project is to replicate this algorithm as part of the crux-toolkit thereby providing a more holistic set of tools for crux-toolkit users.