Семинары 2021

Дата: 24 декабря 2021 г.
Докладчик:  Латыпов Инсан-Александр Искандерович
Тема: "Neuro-Symbolic approaches in Visual Question Answering problems"
Аннотация: : In this presentation, we continue to demonstrate possible solutions in solving Visual Question Answering tasks using Neuro-Symbolic approaches. The discussed MAC architecture utilizes the attention mechanism to focus on the right answer. On the other hand, Neuro-Symbolic Concept Learner uses Domain Specific Language to answer the questions. In this seminar we will discuss the Neural State Machine which is based on traversing the knowledge graphs and operating with the finite set of concepts to perform reasoning.

Дата: 17 декабря 2021 г.
Докладчик:  Латыпов Инсан-Александр Искандерович
Тема: "Neuro-Symbolic approaches in Visual Question Answering problems"
Аннотация: In this presentation we demonstrate possible solutions in solving Visual Question Answering tasks using Neuro-Symbolic approaches. This paradigm aims to bridge the gap between symbolic and connectionist models. Visual Question Answering implies answering the questions based on the given picture and requires reasoning over the extracted information. Models, that we review during this talk, solve the problem of reasoning in different ways. Some of them are based on traversing the knowledge graphs, while others translate the concepts to executable, symbolic programs.

Дата: 26 ноября 2021 г.
Докладчик: Аттила Кертес-Фаркаш
Тема: "Вычислительные методы для аннотирования данных тандемной масс-спектрометрии"
Аннотация: In this talk we present rencently published computational methods and statistical protocols in order to improve the number for spectrum annotation annotated with high confidence. The methods presented can be categorized in few main areas as follows. First, we present new spectrum scoring methods with improved discriminative power. Then we present statistical methods for score calibration or statistical protocols with increased statistical power in spectrum annotation. Then we present methods which find post-translational modifications in the spectrum data. Finally, we present spectrum filtering methods."

Дата: 1 октября 2021 г.
Докладчик: Кудрявцева Полина
Тема: "Deep Convolutional Neural Networks Help Scoring Tandem Mass Spectrometry Data in Database-Searching Approaches"
Аннотация: Были представлены результаты исследований в области тандемной масс спектрометрии, а именно глубокая сверточная нейронная сеть, которая увеличивает количество аннотаций спектра в системах, основанных на поиске по базам данных. Разработанная модель стабильна и быстра в обучении, и она немного превосходит современные современные методы. На семинаре также обсудили архитектуру модели, методы ее оценки и результаты, достигнутые на наборах данных с низким и высоким разрешением. Результаты исследований  были опубликована в журнале Proteome Research в 2021 году.

Дата: 29 июня 2021 г.
Докладчик: Аттила Кертес-Фаркаш
Тема: "Введение в вычислительную масс-спектрометрию" 
Аннотация: Были обозначены общие вопросы применения тандемной масс-спектрометрии, спектрометров и интерпретации данных, а также подробно рассказано о вычислительных методах и протоколах для анализа и проверки аннотаций данных тандемной масс-спектрометрии.

Дата: 25 июня 2021 г.
Докладчик: Аттила Кертес-Фаркаш
Тема: "Введение в вычислительную масс-спектрометрию" 
Аннотация: Были обозначены общие вопросы применения тандемной масс-спектрометрии, спектрометров и интерпретации данных, а также подробно рассказано о вычислительных методах и протоколах для анализа и проверки аннотаций данных тандемной масс-спектрометрии.