Центр искусственного интеллекта НИУ ВШЭ

Искусственный интеллект в биоинформатике

Задачи проекта:

Предсказание кода функциональных геномных элементов методами глубинного обучения на основе омиксных данных молекулярной биологии

  • Разработка эффективных и точных моделей машинного обучения для нахождения вторичных структур ДНК и для выявления значимых ассоциаций с элементами эпигенетического кода.
  • Тестирование эффективности работы моделей на основе других архитектур глубинного обучения – трансформеров.

Уточнение предсказания формы антител и определение эпитопов методами глубинного обучения

  • Компьютерное моделирование взаимодействия антител с антигеном для выборки антител с целью их дальнейшего синтезирования.
  • Разработка алгоритмов, предсказывающих не только неизменяемые части антитела, но и его вариабельные части.

Машинное обучение для решения задач популяционной генетики

  • Изучение механизмов адаптации и естественного отбора как с чисто научной точки зрения, так и в прикладных задачах эпидемиологии, персонализированной медицины и других.

Команда проекта

Попцова Мария Сергеевна

Руководитель проекта

Щур Владимир Львович

Научный работник

Збировская Елена Павловна

Проектный менеджер

Алексеев Кирилл Игоревич

Стажер-исследователь

Коновалов Дмитрий Львович

Стажер-исследователь

Латышев Павел Васильевич

Стажер-исследователь

Шмелев Алексей Валерьевич

Стажер-исследователь