Разработка и применение методов топологического анализа данных для исследования нейронной активности гиппокампа мыши
Выполнили: Горбунов Михаил Андреевич, Чеканов Арсений Михайлович
В 2014 году Джону О’Кифу и Эдварду и Мэй-Бритт Мозерам была присуждена Нобелевская премия за открытие так называемых "нейронов места" и "нейронов решетки". Это нейронные механизмы, помогающие животным ориентироваться и передвигаться в пространстве. Основной вопрос, которому посвящен наш проект: можно ли по нейронной активности мыши восстановить геометрию и топологию пространства? В этой работе рассматриваются записи нейронной активности двух мышей, которые блуждают по аренам с разной топологической структурой (Круглая арена с 1, 2 или 3 пустотами). Один из возможных подходов - использование алгоритмов снижения размерности, отображающее облако точек высокой размерности (записи активности отобранных нейронов) в пространства маленькой размерности, более открытое и к анализу, и к интерпретации. В работе рассматриваются три различных по своей сути алгоритма (PCA, Isomap и Topological Autoencoder), снижающие размерность данных; проводится анализ результатов их работы и попытка дальнейшей интерпретации топологии.
Архив с материалами (Горбунов, Чеканов) (RAR, 5,48 Мб)
В архиве содержатся отчеты по проекту
Руководитель проекта
Нашли опечатку?
Выделите её, нажмите Ctrl+Enter и отправьте нам уведомление. Спасибо за участие!
Сервис предназначен только для отправки сообщений об орфографических и пунктуационных ошибках.