Поздравляем Аттилу Кертес-Фаркаш с успешной защитой докторской диссертации

19 мая 2022 г. состоялась защита докторской диссертации Аттилы Кертес-Фаркаш.

19 мая 2022 года защитил докторскую диссертацию доцент департамента анализа данных и искусственного интеллекта, заведующий научно-учебной лабораторией искусственного интеллекта для вычислительной биологии Аттила Кертес-Фаркаш.

Диссертация была защищена по теме "Вычислительные методы для аннотирования данных тандемной масс-спектрометрии", 05.13.17 "Теоретические основы информатики". Защита проходила в дистанционном режиме.

Тандемная масс-спектрометрия стала стандартным методом идентификации молекул и белков в биологических смесях (например, в крови). Полученные данные анализируются с помощью компьютерных программ. Приблизительно 50-80% данных не могут быть достоверно аннотированы из-за следующих проблем: слабая способность функций оценки различать правильные и неправильные аннотации, отсутствие универсальной семантики для необработанных данных, неполные наборы пептидов-кандидатов,  шум, вносимый в данные работой масс-спектрометра, точность детектора.
В данной диссертации представлены новые вычислительные методы для решения первых четырех проблем. Эти методы позволили добиться лучших результатов в аннотации данных на момент публикации. Таким образом, они позволяют производить более точную идентификацию данных и аннотацию спектров. Это позволит правильно интерпретировать экспериментальные данные и принимать решения относительно будущих экспериментов, например, при выборе лекарственной терапии.

Поздравляем с успешной защитой и желаем дальнейших успехов!