Семинар МЛ ТИ "Анализ моделей гидрофобных ядер белка в дискретных решетках"

Дата: 21 мая 2026 г., 18:10 - 19:30

Докладчик: Андрей Игнатов, старший преподаватель департамента программной инженерии

Аннотация: Аннотация: Доклад посвящен одной из подзадач математического моделирования белковых последовательностей – задаче моделирования гидрофобного ядра в глобулярных белках. Данная задача с достаточной точностью решается с помощью комбинаторной оптимизации на дискретных решетках – как двумерных, так и трехмерных. Точный алгоритм решения этой задачи предполагает построение максимально плотного ядра и последующее размещение белковой последовательности в нем, однако самые плотные теоретически допустимые ядра в реальности редко допустимы для целевой последовательности. В данном докладе будут рассмотрены способы определения допустимости размещения целевой последовательности в ядрах. Сформулированы критерии допустимости размещения для двумерного случая, также приведены некоторые теоретические выкладки для трехмерии.