Мария Попцова выступила на Конференции Сбера AI Community 28.01.2022
На конференции AI Community, которая в этом году состоялась в онлайн формате, выступали ведущие международные и российские эксперты в области ИИ, представители бизнеса.
Мария Попцова заведующий международной лабораторией биоинформатики ФКН ВШЭ выступила с докладом «Методы машинного обучения в функциональной геномике».
Мария, обратила внимание на то, что геном представляет собой сложную систему взаимодействий функциональных элементов разных уровней организации самой последовательности ДНК, мотивов, трехмерной структуры, элементов эпигенетического кода и кода вторичных структур ДНК. С помощью методов нейросетевого глубинного обучения стало возможным аггрегирование информации о функциональных элементах разных уровней клеточной организации – геномики, эпигеномики, протеомики, метаболомики – и других “омик”, с целью предсказания функциональных элементов, для которых эксперименты либо не достигли нужного качества, либо отсутствуют.
В докладе она рассказала о методах глубинного обучения, разрабатываемых в международной лаборатории биоинформатики для предсказания вторичных структур ДНК. Были разработаны модели на основе сверточных (CNN), рекуррентных (RNN), генеративно-состязательных (GAN) сетей, а также методы переноса обучения с доменной адаптацией для задач предсказания квадруплексов и Z-ДНК. Также будут представлены разрабатываемые в лаборатории подходы из области объяснительного искусственного интеллекта (XAI) для определения значимых паттернов ассоциации эпигенетического кода и кода вторичных структур ДНК.
Международная лаборатория биоинформатики: Менеджер
Попцова Мария Сергеевна
Международная лаборатория биоинформатики: Заведующий лабораторией