Семинары 2024
17.01.2024 [online] Сравнение методов обнаружения гуаниновых квадруплексов
Zoom
Докладчик: Коновалов Дмитрий, стажер-исследователь
В докладе было представлено сравнение эффективности основных экспериментальных и теоретических методов обнаружения квадруплексов. Описаны их сходства, различия, основные преимущества и недостатки.
21.02.2024 [online] Анализ дифференциальной экспрессии в различных образцах
Zoom
Докладчик: Войтецкий Артем, стажер-исследователь
В докладе был представлен анализ дифференциальной экспрессии в различных образцах. Отдельно сравнивались образцы RNA и small RNA. В ходе анализа исследовалась зависимость дифференцилаьной экспрессии генов в зависимости от наличия или отсутствия генов ADAR и PRKRA. Таким образом планируется узнать, как на что влияют эти два гена. Дополнительно исследовалось влияние интерферона на образцы.
20.03.2024 [online] Анализ данных snRNA-seq рака груди: от первичной опухоли к метастазам
Zoom
Докладчик: Михайлова Анастасия, стажер-исследователь
Технология секвенирования отдельных клеток (scRNA-seq) является важным инструментом для исследования гетерогенности клеток. Данный метод обеспечивает возможность анализа уникальных профилей экспрессии генов и других внутриклеточных параметров, что, в свою очередь, позволяет изучать внутриклеточные процессы, такие как гетерогенность опухолей и их взаимодействие с окружающими тканями.
17.04.2024 [online] Эксперименты по предсказанию Z-DNA моделями машинного обучения обученными
Zoom
Докладчик: Бекназаров Назар, стажер-исследователь
Актуальным стало изучение и предсказание участков Z-DNA в различных организмах. В докладе представлены эксперименты по предсказанию Z-DNA моделями машинного обучения обученными на экспериментальной разметке и анализ полученных предсказаний с последующим сравнением выводов полученных на разных организмах.
15.05.2024 [online] Создание объединенного трека для предсказания Z-флипонов
Zoom
Докладчик: Бекназаров Назар, стажер-исследователь
Для выполнения данной задачи были рассмотрены подходы разработанные для других задач, таких как предсказания квадруплексов. На саминаре были рассмотрены подходы которые могут быть успешны в этой задаче, полученные результаты были апробированы на текущих экспериментальных данных и были выбраны лучшие варианты. Полученные результаты будут опубликованы.
29.05.2024 [online] Регуляция путей клеточной гибели в раковых образцах посредством ADAR и PRKRA
Zoom
Докладчик: Войтецкий Артем, стажер-исследователь
В данном исследовательском проекте мы поставили цель изучить влияние нокаута генов ADAR и PRKRA, а также воздействие интерферона на транскриптом. Эти гены играют важную роль в регуляции РНК и реакции на интерферон, что делает их перспективными мишенями для терапевтических вмешательств. Было обнаружено, что ADAR оказывает значительное влияние на редактирование РНК, а нокаут ADAR и PRKRA приводит к изменениям в экспрессии связанных с ними генов. Особенно тесная связь была выявлена между результатами исследования и раком легких.
03.06.2024 [online] Исследование сигнальных путей подавления иммунного ответа
Zoom
Докладчик: Михайлова Анастасия, стажер-исследователь
В исследовании был проведен систематический анализ профилей одиночных клеток первичных опухолей рака молочной железы и их метастазов в костный мозг. Были выявлены ключевые паттерны взаимодействия между опухолевыми клетками и их микроокружением. Особое внимание было уделено сигнальным путям MIF и MDK, которые играют важную роль в процессе метастазирования, модулируя иммунный ответ и способствуя росту и выживанию раковых клеток. Эти результаты указывают на перспективность данных сигнальных путей в качестве мишеней для терапевтического воздействия при метастатическом раке молочной железы.
22.06.2024 [online] Квадруплексы в промотор-энхансерном взаимодействии
Zoom
Докладчик: Коновалов Дмитрий, стажер-исследователь
В докладе было представлено описание модели взаимодействия квадруплексов внутри пары промотор-энхансер. Модель предполагает стекинг квадруплексов для стабилизации промотор-энхансерной петли. Были приведены результаты проверки модели, представлены итоги статистического анализа экспериментальных данных колокализации квадруплексов.
Нашли опечатку?
Выделите её, нажмите Ctrl+Enter и отправьте нам уведомление. Спасибо за участие!
Сервис предназначен только для отправки сообщений об орфографических и пунктуационных ошибках.