Опубликована статья в журнале Life Science Alliance
В журнале Life Science Alliance публикована статья «Open Access Z-flipon variants reveal the many roles of Z-DNA and Z-RNA in health and disease»
10 мая опубликована статья Alliance публикована статья «Open Access Z-flipon variants reveal the many roles of Z-DNA and Z-RNA in health and disease» в журнале Life Science, в которой ученые представили свой опыт.
Над проектом работали Анна Данилова стажер-исследователь МЛБ НИУ ВШЭ, Назар Бекназаров аспирант ФКН НИУ ВШЭ, Дмитрий Коновалов стажер-исследователь МЛБ НИУ ВШЭ, Александр Федоров младший научный сотрудник МЛБ НИУ ВШЭ, Алан Герберт научный консультант, Мария Попцова заведующий лаборатории МЛБ НИУ ВШЭ.
Выявление роли Z-ДНК остается сложной задачей, учитывая их динамичный характер. Здесь мы проводим опрос всего генома с помощью алгоритма преобразователя DNABERT, обученного на экспериментально идентифицированных последовательностях, образующих Z-ДНК (Z-флипоны). Алгоритм обеспечивает значительное повышение производительности (F1 = 0,83) по сравнению с существующими подходами и реализует вычислительный мутагенез для оценки влияния замены оснований на формирование Z-ДНК. Более подробно ознакомиться со статьей здесь.