• A
  • A
  • A
  • АБВ
  • АБВ
  • АБВ
  • А
  • А
  • А
  • А
  • А
Обычная версия сайта

Международная лаборатория биоинформатики

Лаборатория создана в 2018 году для развития направления биоинформатики на факультете компьютерных наук. Международная лаборатория биоинформатики активно занимается разработкой и применением самых современных методов машинного обучения и искусственного интеллекта для анализа омиксных данных молекулярной биологии.

Основными направлениями научной деятельности лаборатории являются:

1. Фундаментальные исследования роли вторичных структур ДНК, их взаимосвязь с эпигенетическим кодом. Практическое применение исследований направлено на разработку лекарств, управляющих работой флипонов – вторичных структур ДНК, регулирующих работу генома. В частности было предложено потенциальное лекарство против рака, регулирующее работу генома посредством включения одного из флипонов – Z-ДНК. 

2.  Разработка пайплайн анализа геномных данных секвенирования, генетических панелей. Полный анализ от варианта к фенотипу. С 2019 года лаборатория взаимодействует с медицинскими учреждениями и фармкомпаниями по данному направлению деятельности.

3. Машинное обучение в биоинформатике. Работа по данному направлению осуществляется с 2018 года. Международная лаборатория биоинформатики сотрудничает с крупными индустриальными партнерами.

4. Генетические исследования в области кардиогенетики, сфокусированные на создание каталога мутаций пациентов с сердечно-сосудистыми заболеваниями. В 2020 году создан Консорциум «Генетика сердечно-сосудистых заболеваний».

5. Создание систем ИИ в биоинформатике. Создание систем ИИ для прогнозирования диагностики и течения заболеваний на основе клинических данных пациентов. С 2020 года в рамках данного направления деятельности лаборатории сделаны первые системы для прогнозирования побочных эффектов антикоагулянтов, антидепрессантов и антипсихотиков. Данное направление находит применение в фармкомпаниях.

Результаты научно-исследовательской работы лаборатории публикуются в российских и зарубежных журналах. Регулярно проводятся различные научные и образовательные мероприятия по тематике исследований, такие как научные семинары по методам машинного обучения в биоинформатике, летние и зимние школы по биоинформатике, круглые столы, конференции и ежегодный междисциплинарный форум Консорциума «Генетика сердечно-сосудистых заболеваний». Международная лаборатория биоинформатики ведет активное сотрудничество с ведущими лабораториями мирового уровня. 

Новости

10.04.2025 года Попцова Мария, заведующий Международной лаборатории биоинформатики факультета компьютерных наук НИУ ВШЭ, выступила на совещании ФКН с докладом «Кардиогенетика: шаг на пути к персонализированной медицине XXI века»
10 апреля
8 апреля 2025 года Назар Бекназаров, аспирант международной лаборатории биоинформатики факультета компьютерных наук НИУ ВШЭ, принял участие в Международной конференции «Параллельные вычислительные технологии 2025» (PCT 2025), где выступил с докладом «Optimizing Computational Infrastructure for LLMs in Bioinformatics: A Case Study».
8 апреля
Команда ученых из ВШЭ и НИЦ «Курчатовский институт» применила методы машинного обучения для исследования генетической предрасположенности к инсульту. Анализ геномов более чем 5000 человек позволил выявить 131 ген, ассоциированный с риском ишемического инсульта. Для двух генов связь показали впервые. Работа опубликована в PeerJ Computer Science.
2 апреля
Высшая школа экономики — один из ключевых национальных центров компетенций, куда обращаются компании для решения задач по разработке и внедрению ИИ-технологий. Успешные кейсы такого сотрудничества были представлены Институтом искусственного интеллекта и цифровых наук факультета компьютерных наук НИУ ВШЭ на площадке информационной группы «Интерфакс».
31 марта
Научный консультант Международной лаборатории биоинформатики Института искусственного интеллекта и цифровых наук Алан Герберт предложил новое объяснение одной из нерешенных загадок биологии — происхождения генетического кода. Согласно исследованию, опубликованному в журнале Biology Letters, современный генетический код мог возникнуть благодаря самоорганизующимся молекулярным комплексам — тинкерам. Новую гипотезу автор выдвинул на основе анализа вторичных структур ДНК с помощью нейросети AlphaFold3.
27 марта
В УЦ Вороново НИУ ВШЭ прошла ежегодная Зимняя школа-конференция по биоинформатике с участием соорганизатора, Международной лаборатории статистической и вычислительной геномики», на которой приняли участие более 100 человек из ВШЭ, ИППИ РАН, Сколтеха, МГУ, МФТИ.
27 февраля
Документальный фильм о факультете компьютерных наук (ФКН) Вышки появился в онлайн-кинотеатре «Кинопоиск». Теперь миллионы зрителей смогут из первых уст узнать о становлении одного из флагманских ИТ-факультетов страны, который был открыт Высшей школой экономики и «Яндексом» в 2014 году.
26 февраля
14 ноября 2024 года в Национальном исследовательском университете «Высшая школа экономики» (НИУ ВШЭ) состоялась международная научная конференция «Развитие российско-итальянского взаимодействия в сфере биомедицины».
14 ноября, 2024 г.
Исследователи из НИУ ВШЭ разработали модель машинного обучения, которая предсказывает риск развития осложнений у пациентов, перенесших инфаркт миокарда. В модели впервые учли генетические данные, что позволило точнее оценить риск долгосрочных осложнений. Исследование опубликовано в журнале Frontiers in Medicine.
7 ноября, 2024 г.
В конце августа 2024 года были подведены итоги рассмотрения первых проектов по коммерциализации в рамках реализации соответствующей меры поддержки. С сентября 2024 года два проекта факультета компьютерных наук НИУ ВШЭ — «КардиоЖизнь» и «Меланж» — получили возможность развивать свои продукты и услуги для целей коммерциализации на открытом рынке с помощью финансовой поддержки.
3 октября, 2024 г.
Еще новости