• A
  • A
  • A
  • АБВ
  • АБВ
  • АБВ
  • А
  • А
  • А
  • А
  • А
Обычная версия сайта

Международная лаборатория биоинформатики

Лаборатория создана в 2018 году для развития направления биоинформатики на факультете компьютерных наук. Международная лаборатория биоинформатики активно занимается разработкой и применением самых современных методов машинного обучения и искусственного интеллекта для анализа омиксных данных молекулярной биологии.

Основными направлениями научной деятельности лаборатории являются:

1. Фундаментальные исследования роли вторичных структур ДНК, их взаимосвязь с эпигенетическим кодом. Практическое применение исследований направлено на разработку лекарств, управляющих работой флипонов – вторичных структур ДНК, регулирующих работу генома. В частности было предложено потенциальное лекарство против рака, регулирующее работу генома посредством включения одного из флипонов – Z-ДНК. 

2.  Разработка пайплайн анализа геномных данных секвенирования, генетических панелей. Полный анализ от варианта к фенотипу. С 2019 года лаборатория взаимодействует с медицинскими учреждениями и фармкомпаниями по данному направлению деятельности.

3. Машинное обучение в биоинформатике. Работа по данному направлению осуществляется с 2018 года. Международная лаборатория биоинформатики сотрудничает с крупными индустриальными партнерами.

4. Генетические исследования в области кардиогенетики, сфокусированные на создание каталога мутаций пациентов с сердечно-сосудистыми заболеваниями. В 2020 году создан Консорциум «Генетика Сердечно-Сосудистых Заболеваний».

5. Создание систем ИИ в биоинформатике. Создание систем ИИ для прогнозирования диагностики и течения заболеваний на основе клинических данных пациентов. С 2020 года в рамках данного направления деятельности лаборатории сделаны первые системы для прогнозирования побочных эффектов антикоагулянтов, антидепрессантов и антипсихотиков. Данное направление находит применение в фармкомпаниях.

Результаты научно-исследовательской работы лаборатории публикуются в российских и зарубежных журналах. Регулярно проводятся различные научные и образовательные мероприятия по тематике исследований, такие как научные семинары по методам машинного обучения в биоинформатике, летние и зимние школы по биоинформатике, круглые столы, конференции и ежегодный междисциплинарный форум Консорциума «Генетика Сердечно-Сосудистых Заболеваний». Международная лаборатория биоинформатики ведет активное сотрудничество с ведущими лабораториями мирового уровня. 

Новости

Международная лаборатория биоинформатики приняла участие в школе для молодых ученых «Генетика и эпигенетика: механизмы, структура, функция», которая проходила на Биологическом факультете МГУ имени М.В. Ломоносова с 29 по 30 октября 2022 года.
31 октября
2-6 октября 2022 прошла 46-я междисциплинарная школа-конференция «Информационные технологии и системы» (ИТиС). 
6 октября
Произошел квантовый скачок в создании научных зум-коллабораций во всем мире. 
22 сентября
2 сентября в НИУ ВШЭ состоялось второе мероприятие консорциума «Генетика сердечно-сосудистых заболеваний» — междисциплинарный форум «Кардиогенетика и биоинформатика: реалии 2022», который продолжил работу консорциума между организациями, входящими в состав консорциума. В форуме приняли участие руководители и представители научных центров и институтов Москвы, Санкт-Петербурга, Новосибирска, Архангельска, Тюмени и Сургута.
2 сентября
На факультете компьютерных наук Вышки с 23 по 25 августа провели школу по машинному обучению в биоинформатике. Проект, два предыдущих года проходивший онлайн, был впервые реализован в очном формате. За три дня более 120 участников прослушали лекции и семинары от ведущих специалистов в данной области из ВШЭ, Сколтеха, AIRI, МГУ, МФТИ, Genotek, Sber Artificial Intelligence Laboratory.
2 сентября
В РМАНПО 22 июня 2022г. состоялся Круглый стол консорциума «Генетика сердечно-сосудистых заболеваний», в рамках которого приняли участие представители 11 организаций.
24 июня
25 мая 2022 года на факультете компьютерных наук прошла онлайн-конференция ABZ2022.
21 июня
В журнале Nature 25 мая 2022 г. была опубликована статья «ADAR1 маскирует иммунотерапевтический потенциал рака при некроптозе, вызванном ZBP1» (ADAR1 masks the cancer immunotherapeutic promise of ZBP1-driven necroptosis) Александра Федорова, Назара Бекназарова, Алана Герберта, Марии Попцовой.
25 мая
В Центре искусственного интеллекта ВШЭ ведется работа по 25 направлениям. Группы ученых участвуют в конференциях и семинарах, пишут статьи, проводят воркшопы. Делать выводы и подводить итоги ещё рано, поэтому о промежуточных этапах и планах можно узнать из интервью с руководителями проектов.  
14 марта
Еще новости